根据2004年版“中国科技期刊引证报告”，大气物理所两个中文期刊的引证数据均有大幅度提高。《大气科学》的影响因子和总被引频次分别为1.079和1249，首次突破1和1000大关，在1576种“统计源期刊”中分别排名55和68，连续第三次获“百种杰出学术期刊”称号。《气候与环境研究》的影响因子和总被引频次分别为0.739和288，比上年有大幅度提高，在1576种“统计源期刊”中分别排名135和616，达到中上游水平。这对一个创刊不到10年的新刊来说，进步不能说不快。

    根据最新发布的ISI Jounral Citation Reports，英文期刊《大气科学进展》的影响因子和总被引频次分别为0.449和231，均比上年有较大幅度的增长。另外，《大气科学进展》又获2004-2005年度国家自然科学基金“重点学术期刊专项基金”的资助，这是《大气科学进展》连续第3期获得资助。《大气科学进展》还获得海洋之神8590vip高水平学术期刊基础设施建设项目“期刊办公自动化系统和期刊发布交流平台”的资助。