2004年12月24日，第三届国家期刊奖评选工作办公室公示了入围第三届国家期刊奖的60种期刊名单，其中社科类期刊30种，科技类期刊30种，科技类期刊中纯学术期刊共15种；入围国家期刊奖提名奖的100种期刊名单，其中社科类期刊50种，科技类期刊50种；国家期刊奖百种重点期刊奖的197种期刊名单中社科类期刊97种，科技类期刊100种。此次我院共有27种科技期刊分别入围第三届国家期刊奖、国家期刊奖提名奖及国家期刊奖百种重点期刊奖公示名单。

    其中中科院7种期刊入围第三届国家期刊奖，占科技类期刊的23.3%，其中入围学术期刊占15种学术期刊的40%。这7种入围期刊分别为《自动化学报》、《金属学报》、《高分子学报》、《电脑爱好者》、《物理学报》、《科学通报》、《中国物理快报》。

    中科院12种期刊入围国家期刊奖提名奖，占科技类期刊的24%，比上届提名奖数量翻了一番。这12种入围期刊分别为《遗传学报》、《新型炭材料》、《催化学报》、《生态学报》、《计算机辅助设计与图形学学报》、《冰川冻土》、《海洋与湖沼》、《植物学报》、《水土保持学报》、《中国科技期刊研究》、《图书情报工作》、《中国国家地理》。

    中科院8种期刊入围国家期刊奖百种重点期刊奖，占科技类期刊的8%。这8种入围期刊分别为《地理学报》、《地球物理学报》、《分析化学》、《中国环境科学》、《计算机学报》、《化学学报》、《中国科学B辑》、《生理学报》。