经过中国精品科技期刊遴选指标体系综合评价，成都生物所主办的学术期刊《应用与环境生物学报》被中国科学技术信息研究所评选为2008年度“中国精品科技期刊”。 此次评选属全国首次，这一评选结果充分肯定了该学报在研究所、历届编委、科研人员和学报编辑部的共同努力下取得的进步与成就。

中国科学技术信息研究所每年都会出版中国最权威的《中国科技期刊引证报告》。该报告2008年收录1765种核心期刊，此次首次从中评选出300余种作为精品科技期刊。四川省仅6种期刊获此荣誉，而成都生物所的《应用与环境生物学报》便是其中之一。其评选标准不单纯依据大家最为熟悉和重视的影响因子或总被引频次，而是采用三大类共21项的指标体系以比例和权重来进行综合评价和遴选。其中，“学术质量水平”（60%）包括影响因子、总被引频次、基金论文比、他引总引比等9项指标，“国际竞争力水平”（30%）包括被国际重要检索系统收录情况、是否属于有相对国际优势的学科、国际影响等6项指标，以及“可持续发展潜力”（10%）包括办刊单位支持情况、期刊电子化水平、编辑出版质量等6项指标。这种评选更能体现学术期刊的真实水平、地位与发展前景。

成都生物所《应用与环境生物学报》自创办之日起就一贯坚持以社会效益为主、社会效益与经济效益并重的办刊方针，紧紧围绕“传播和交流生物科学研究成果、新进展，从而服务于国民经济建设和人民生活水平提高”的办刊宗旨，着力加强“以阅读和引用为目标”的工作理念和以“作者-读者-学者”为中心的服务思想，走精品科技期刊发展道路，既不陷入“唯SCI论”、“唯影响因子论”的偏激，也不追赶“唯经济效益论”的风潮，而是以高度的责任心和使命感不断提升学报的学术水平和编辑质量，同时加强国内外宣传和交流，获得了社会效益和经济效益双增长，很好地契合了国家近来关于学术期刊“精品化”发展战略的指导思想。因而此次《应用与环境生物学报》成为精品期刊也属实至名归。

《应用与环境生物学报》编辑部在研究所的领导和科技信息情报中心的协调支持下，树立办好刊、办精品科技期刊的理念与信心，努力顺应科学技术发展需求和科技期刊发展趋势，在学报的精品化、国际化、网络化、规范化等方面采取了许多有效措施，取得了良好效果，在同类中文期刊中当属前列，已颇具国际影响。例如，自2008年8月第4期起，学报论文开始使用数字对象标识符（Digital object identifier, DOI），也即数字文献条形码。DOI为发表论文标注了“身份证”，通过DOI系统及其应用系统CrossRef，读者可在任何一个文献检索平台进行从引文到全文的链接，实现一站式检索和阅读，从而为促进学报的国际传播、交流和影响力开辟了新途径。学报继续增聘外籍编委，目前外籍编委已达5人，分别来自新西兰、英国、美国和加拿大；学报加强国内外宣传与交流，使其机构用户已达3077个，分布于8个国家和地区，国外用户有美国国会图书馆、代顿ITS公司、法国国防部、拜尔生物科学、日本国会图书馆、新加坡国家图书馆等，个人读者则分布于30个国家和地区。又如，编辑部不遗余力地推进学报的网络化工作，继建立学报动态网站、英文网站，实现论文全文检索和后台管理后，又着手工作流程的电子化，在线办公系统2009年初正式启用，实现了学报工作流程的数字化、电子化和网络化。此外，《应用与环境生物学报》的编辑、编务和出版工作始终遵循国家标准、行业规范和相关规定，尤其在很多科研人员容易发生错误的量、单位和符号使用方面严格把关，该学报的规范化编辑在期刊届做得尤其突出。

精益求精是《应用与环境生物学报》一贯的追求，该学报还有一些不足需要去改进、还有很多空间需要去拓展。比如学科的特色反映和对高质量论文的组织与吸引、国际影响力的提升、网络期刊的创办和办刊学术理论的探讨、编辑规范的国际化和学报深度宣传与交流等等。此次获评2008年度“中国精品科技期刊”，将激励编辑部再接再厉，努力将该学报办成社会效益与经济效益完美结合、为我国科学技术发展提供更高水平服务的优秀科技期刊。