8月13日至17日，2012年度新一代高通量生物信息分析培训班在中科院南京土壤研究所举办。共有200余位学员参加了理论培训，50余位学员参加了实践操作培训。本次培训班由美国密西根州立大学微生物生态中心和土壤与农业可持续发展国家重点实验室联合承办。

培训班上，密西根州立大学核糖体RNA数据库项目（Ribosomal Database Project，简称RDP）核心生物信息专家柴本立和王琼研究员系统阐述了新一代高通量数据分析的基本原理、技术路线、主要问题与应对策略等。授课内容主要包括五个部分：1）微生物群落多样性探索。重点介绍了从未知的高通量序列到已知的微生物物种和微生物物种鉴定策略；2）高通量分析路线。重点讲解了基于功能基因的高通量测序与基于鸟枪法的全基因组测序比较、功能导向的环境基因组研究策略、新一代测序技术平台及其优缺点、PCR偏好性评价及实验室优化策略和新一代高通量数据处理方法；3）生态分析方法。包括特征微生物分析和相关性分析方法、环境参数与数据处理范本以及基因组标准等；4）微生物多样性与功能。重点讲述了生态过程特征功能基因的特点与优势、基因移码校正、无参考序列的数据分析方法、高通量功能基因序列的分类与功能鉴定以及目标基因导向的鸟枪法环境基因组拼接；5）生物信息分析前沿。

针对未来新一代高通量测序技术的快速发展，授课专家就海量信息的挖掘与测试、误差分析和功能基因开发提出了独到的见解，并与学员分享了他们最新开发的新工具。

授课结束后，还系统进行了新一代高通量生物信息分析实践操作培训。

RDP是目前世界上最大的核糖体序列数据库，美国科学院院士James Tiedje教授创建并由其团队维护，是目前国际上最负盛名的微生物多样性研究平台。本次培训是RDP团队首次在北美以外的地区进行，体现了我国近年来在新一代高通量测序研究微生物多样性与功能方面的快速发展。本次培训改变了过去对新一代高通量测序分析的传统认识，有效推动了新一代高通量测序在不同学科领域的应用，提升了学员的数据分析和信息挖掘能力，为加强不同学科领域交叉研究提供了很好的技术支撑。